IC保密性能到底如何？大家都知道IC卡最大的优点除了容量大以外（目前容量达4M的IC卡芯片模块已经诞生）就是比磁卡具有更高的可靠性、安全性和灵活性。磁卡在广泛使用的几十年中给金融界和用户带来了很大的便利，但它比较容易被修改、复制和仿造的缺陷带来了严重的损失和威胁。据资料统计，1993 年仅中国银行上海分行就发现90多张伪卡。在亚洲，利用维萨集团发行的维萨卡作弊，每年就损失1亿美元。
而IC卡可从许多方面保证它的安全性，包括：
a软件控制的安全性；
b生产过程的安全性；
c用户密码控制的安全性；
d生物认证信息提供的安全性。
由于磁卡没有IC卡那样严密的生产流程，也没有对读写内容进行控制的逻辑电路，且不能提供较大的存储容量，因此，磁卡无法达到IC卡的安全程度它逐步被IC卡代替是必然趋势，随着我国“三金工程”的实施，IC卡的应用有着重大意义。
IC卡加密系统的实现：IC卡有较强的保密性，除了物理上依赖于不可擦除的存储器之外，逻辑上则完全依赖于制造卡时使用的加密系统和识别卡时的鉴别系统。现代密码学提供了一些特别设计的加密／解密系统，这些标准的密码系统具有可靠的理论基础，并已在应用中得到检验，容易得到用户信赖。
在DES的算法中，主要的运算是置换、移位和模2加，其中移位和模2加无论用何种计算机语言都不难实现，只有置换运算需要较复杂的处理才能完成，其中关键是在以BYTE为单位存储的一组数据中找到指定bit的值。S盒置换是DES算法中比较独特的一个步骤。它是将一个6bit的数据(d5d4d3d2d1d0)的d5d0作为行号，d4d3d2d1作为列号在4行16列的S盒中的数据作为置换结果。DES算法现已用Z80汇编语言实现，并准备将其用在国产IC卡电话的加密系统中。
经过我们对国外IC卡应用实例的广泛研究，认为DES系统(对称密钥密码算法或秘密密钥密码算法)是至今为止应用最广泛、最安全的加密系统。DES系统是传统的分组密码学的典型代表。在DES算法设计中采用了基本的隐蔽信息的技术：散布和混乱，构成算法的基本单元是简单的置换、移位和模2加运算，可在任何普通的计算机上实现。DES最引人注目的地方是它的算法和数据完全公开，以DES算法的特点，理论上用穷举法肯定可以找到所用的密钥，但是，以目前的硬件速度和价格还是无法做到的。而且，DES发表近20年来，无数专业人员已为DES的安全性做了大量研究工作，迄今为止，还没有人确信它是可以攻破的。
IC卡可分为智能卡和存储卡两类。对于无CPU的存储卡，可以在制造和发行卡时对卡上需加密的一组特定数据和密钥进行运算，产生的密码也存入该卡中，用户使用该卡时，装在鉴别系统中的同样的DES系统会会对卡上的同一组数据和密钥进行计算，结果应与卡中的密码相同。而对于带CPU的智能卡，只需在使用卡时用鉴别系统中的DES和特定的密钥计算卡上的一组数据M，加密结果传给IC卡，再由该卡的CPU用相应的密钥解密后还原M，这种在卡上不存储密码信息的方式更具保密性。
